ImageJ Automatische Bildanalyse

Downloads

Man zieht den plugins order aus der .zip in den Fiji Ordner.

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Die OCT-A Bilder können sich in Unterordner befinden oder all in einem ordern sein. WICHTIG ist aber wie die Bilder benannt sind. Sie sollten nach diesem Muster gespeichert werden:

Es ist auch möglich sie in diesem Muster zu speichern:

Am Wichtigsten ist es das man AUGE_TYP trennt wie hier GDCXXX_OD_2018_SVC. Man kann auch XXX_AUGE_XXX_TYP oder XXX_AUGE_TYPE_XXX schreiben. Sollte das nicht funkonieren es ist Wahrscheinlich ein Bug im Plugin.

Es ist erlaubt Text vor oder nach SVP_OD zu haben. Wie 000_SVP_OD_GDC.tif wäre auch möglich. Es ist wichtig das die Datein den Typ und das Auge haben, damit man sie zuordnen kann. Der text muss mit einem unterstrich _ getrennt werden.

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Doppelklick auf das Wand Tool um es zu konfigurieren.

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Tolerance 5 und mode 4-connected sind gute defaults. Man sollte aber nach qualität des Bildes dynamisch entscheiden. Man kann auch die anderen polygon tools verwenden um einen FAZ bereich einzuzeichnen.

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Am Ende hat man zwei Datein.

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